ABSTRAKPengelolaan keuangan daerah meliputi penatausahaan keuangan daerah yang harus dipahami dengan baik. Sistem Informasi Manajemen Daearah (SIMDA) yang dibuat oleh Badan Pengawas Keuangan dan Pembangunan (BPKP) dan telah dikembangkan menjadi Financial Management Information System (FMIS ) bertujuan untuk membantu pemerintah daerah dalam melakukan pengelolaan keuangan daerah. Pelayanan pembayaran pajak pada Badan Pendapatan Daerah ( BAPENDA ) Kabupaten Nunukan melalui aplikasi Elektronik Bapak Tiri Hebat ( Bayar Pajak Tidak Ribet, Hemat Biaya, Akuntable dan Transparan ) dan pembayaran secara manual melalui rekening kas daerah. Bendahara Penerimaan BAPENDA Kabupaten Nunukan melaksanakan penatausahaan penerimaan pajak dan retribusi daerah melalui aplikasi SIMDA FMIS dari dua sumber yaitu data dari Aplikasi Bapak Tiri Hebat dan melalui rekonsiliasi pendapatan. Adapun tujuan dari karya ilmiah ini, untuk mengetahui implementasi Sistem Aplikasi Informasi terhadap pelaksanaan tugas bendahara penerimaan Badan pendapatan Daerah Kabupaten Nunukan. Metode yang digunakan adalah kualitatif. Teknik pengumpulan data dengan metode purposive sampling. Pengumpulan data melalui wawancara, observasi dan dokumentasi. Hasil penelitian menunjukan implementasi Sistem Aplikasi Informasi terhadap pelaksanaan tugas Bendahara Penerimaan BAPENDA Kabupaten Nunukan belum maksimal.. Hal ini terjadi karena adanya perbedaan data, gangguan jaringan, aplikasi yang terkadang error dan pemahaman terhadap penggunaan sistem aplikasi yang masih kurang.